近日,中国科学院上海药物研究所郑明月团队开发出基于生成式AI的蛋白-配体复合物结构预测方法SurfDock。这一方法利用蛋白质表面信息构建几何扩散神经网络,高精度自动生成配体结合构象,并应用于基于结构的虚拟筛选。相关研究成果以SurfDock is a surface-informed diffusion generative model for reliable and accurate protein–ligand complex prediction为题,在线发表在《自然-方法》(Nature Methods)上。研究蛋白-配体相互作用是分子生物学和生物化学的基础。从酶催化到信号传导,这些相互作用构成了众多细胞过程的核心。研究蛋白
近日,中国科学院云南天文台科研人员与合作者在活动星系核宽线区结构和动力学演化研究方面取得进展。相关研究成果以Velocity-resolved Reverberation Mapping of Changing-look Active Galactic Nucleus NGC 4151 during Outburst Stage. II. Four Season Observation Results为题,发表在《天体物理学杂志》(The Astrophysical Journal)上。活动星系核的紫外和光学光谱存在较多宽度超过1000公里每秒的宽发射线。宽发射线的辐射区称为宽线区。宽线区中的气体速度高,在中心吸积盘高能光子的光致电离作用下产生宽发射线。研究宽线区的结构
卤素原子转移是通过亲核自由基直接攫取卤素原子来生成活性自由基的方式,也是通过有机卤化物产生相应的碳自由基的重要策略。通常,对C-X键而言,这一策略仅适用于氯、溴、碘等元素。由于碳-氟键的热力学稳定性高并具有动力学惰性,在碳-氢键同时存在的条件下,自由基如何直接攫取碳-氟键的氟原子是这一领域的难题。近期,中国科学院上海有机化学研究所研究员薛小松团队在《德国应用化学》上,发表了题为C(sp3)-F Bond Activation by Lewis Base-Boryl Radicals via Concerted Electron-Fluoride Transfer的研究论文。该研究通过DFT计算探讨